Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJC1P36383 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJC1P36383 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms