Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms