Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms