Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms