Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIG1P18858 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIG1P18858 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIG1P18858 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIG1P18858 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIG1P18858 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIG1P18858 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIG1P18858 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIG1P18858 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIG1P18858 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIG1P18858 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIG1P18858 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIG1P18858 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIG1P18858 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIG1P18858 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIG1P18858 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms