Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF4P18848 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF4P18848 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF4P18848 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF4P18848 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF4P18848 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF4P18848 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF4P18848 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF4P18848 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms