Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms