Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRY3O43610 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms