Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms