Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms