Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF5Q9Y2D1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF5Q9Y2D1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF5Q9Y2D1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF5Q9Y2D1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF5Q9Y2D1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF5Q9Y2D1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF5Q9Y2D1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF5Q9Y2D1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF5Q9Y2D1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF5Q9Y2D1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms