Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAPRE3Q9UPY8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAPRE3Q9UPY8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAPRE3Q9UPY8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAPRE3Q9UPY8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAPRE3Q9UPY8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAPRE3Q9UPY8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAPRE3Q9UPY8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAPRE3Q9UPY8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAPRE3Q9UPY8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAPRE3Q9UPY8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms