Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms