Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAI1Q9UI46 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms