Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGC1AQ9UBK2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms