Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms