Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMT1Q9NXH9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms