Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DNAJC28Q9NX36 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms