Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3AQ9NVI7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms