Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms