Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CLMPQ9H6B4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLMPQ9H6B4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLMPQ9H6B4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms