Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms