Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms