Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BARHL1Q9BZE3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms