Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms