Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms