Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRIP3Q9BW71 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms