Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms