Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5Q99717 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5Q99717 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms