Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms