Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX18Q96RF0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX18Q96RF0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms