Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms