Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms