Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms