Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BICD1Q96G01 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BICD1Q96G01 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms