Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL5Q93034 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms