Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms