Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms