Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms