Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPN12Q6ZSI9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPN12Q6ZSI9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms