Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf50Q6ZRC1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf50Q6ZRC1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms