Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms