Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms