Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN4Q56A73 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms