Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TNXAQ16473 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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