Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms