Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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