Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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