Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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COL4A6Q14031 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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COL4A6Q14031 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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COL4A6Q14031 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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COL4A6Q14031 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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COL4A6Q14031 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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