Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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TUBB3Q13509 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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